Fold changes

17:27 Jan 18, 2015 

Ce que je dis simplement, c'est que les références que vous citez sont en accord avec l'interprétation que je fais de "fold change" et que cela n'a rien à voir avec la conformation de la protéine.
Oui, vos références proviennent de Nature, mais elles ne parlent pas de "folding" pour autant. La "contradiction" dont vous parlez vient tout simplement de la signification biologique.
Après, vous avez raison, c'est orgozozo qui dispose de l'ensemble du texte source et est donc à même de savoir, dans son contexte, ce que signifie cet assemblage de mots.
Je crois avoir suffisamment expliquer mon point de vue...

16:27 Jan 18, 2015 

as you have the whole of the ST you are in best position to see which interpretation of "fold" fits or not.
The basic meaning of "fold" would suggest to look for the "folding" of something - like a protein chain.
Understanding "fold" (as used in this sentence) as a kind of "facteur multiplicatif" would grammatically stretch quite a lot the meaning of "fold"; not impossible, but unlikely.

@Audrey Bernard-Petitjean

"le texte parle de "fold changes in protein levels"...." agree TOTALLY about that; what I don't see is: where is the contradiction with the links I suggested to use in order to get to the meaning of it?
These documents are exactly about "fold changes" and "protein levels", these are perfectly good sources but you need a lot of time (that I don't have now) to understand all the fine points and nuances, and a lot more of the ST to see how it fits. It's only a first step for sure, but a usable first step.

11:59 Jan 17, 2015 

C'est bien du level of protein qu'il s'agit, et je pense qu'il n'est pas donné en unités mais en facteur multiplicatif comme tu dis si bien

11:48 Jan 17, 2015 

je ne pense pas que "fold" fasse référence à la conformation des protéines ici (folding) puisque le texte parle de "fold changes in protein levels".
Et dans votre référence, le point b montre un Western blot : il s'agit de la quantité d'une protéine P après induction (ou non) d'un shRNA, c'est-à-dire inhibition (ou non) de son expression. Le point d, quant à lui, montre le nombre de protéines dont l'expression a été modifiée d'au moins 25 % après l'inhibition de P, classées en fonction de leur catégorie fonctionnelle. Comme le dit orgozozo, "fold change" fait donc référence à un facteur de modification. Ce qui revient à déterminer la variation de l'expression des protéines selon un facteur multiplicatif.
C'est ce que je comprends en tout cas.

11:06 Jan 17, 2015 

yes, it's something to do with the changes in the folding of the protein's chain of amino acids, [not how much protein is found in the sample] that much I could guess - but I'm not sure of the fine technical details.

10:58 Jan 17, 2015 

Il semble bien qu'il s'agisse d'un facteur de modification (±0,25)

10:41 Jan 17, 2015 

this can found in any standard dictionary? not convinced...

any "standard dictionary" you have in mind? That will be good enough to deal with s.t. like this:

"... (d) Proteins differentially expressed between the shSC and shFUS1 samples by a fold change of at least ±0.25 in two of three replicates were grouped into functional categories based on the literature (Table 1) ..."

http://www.nature.com/cddis/journal/v5/n12/fig_tab/cddis2014...