Glossary entry (derived from question below)
English term or phrase:
mate-pair
Polish translation:
sekwencjonowanie (genomowego DNA za pomocą krótkich odczytów) typu Mate-Pair
Added to glossary by
Kamila Ołtarzewska
Apr 13, 2020 07:57
4 yrs ago
15 viewers *
English term
mate-pair
English to Polish
Science
Genetics
genome assembly
The text is about building the structure of human DNA strands.
I assume that "genome assembly" is decoding the sequences, then what about: "Long-read, linked-read, and mate-pair technologies are limited in their scaffolding abilities by the size of the inserts."
I assume that "genome assembly" is decoding the sequences, then what about: "Long-read, linked-read, and mate-pair technologies are limited in their scaffolding abilities by the size of the inserts."
Proposed translations
(Polish)
3 | sekwencjonowanie (genomowego DNA za pomocą krótkich odczytów) typu Mate-Pair | Frank Szmulowicz, Ph. D. |
References
What is mate pair sequencing for? | geopiet |
Proposed translations
5 hrs
Selected
sekwencjonowanie (genomowego DNA za pomocą krótkich odczytów) typu Mate-Pair
Mate pair sequencing involves generating long-insert paired-end DNA libraries useful for a number of sequencing applications, including: De novo sequencing. Genome finishing. Structural variant detection. Identification of complex genomic rearrangements.
https://www.illumina.com/science/technology/next-generation-...
cccccccccccccc
Analiza genomu
- Sekwencjonowanie całogenomowe,
- Sekwencjonowanie de novo,
- Sekwencjonowanie de novo małych genomów (bakterie, drożdże, wirusy) lub plazmidów
- Sekwencjonowanie typu Mate Pair,
- Sekwencjonowanie exomów,
- Resekwencjonowanie celowane,
- Sekwencjonowanie amplikonów,
https://biotechnologia.pl/uslugi/sekwencjonowanie-ngs,1003?c...
Analiza genomów musi zostać przeprowadzona z zastosowaniem różnych technologii obejmujących wysokoprzepustowe sekwencjonowanie genomowego DNA za pomocą krótkich odczytów sparowanych (paired-end), krótkich odczytów typu mate-pair, długich odczytów łączonych (ang. linked-reads), naturalnie długich odczytów analizowanych w czasie rzeczywistym oraz sporządzenie mapy optycznej genomu.
https://ted.europa.eu/udl?uri=TED:NOTICE:571402-2019:TEXT:DA...
https://www.illumina.com/science/technology/next-generation-...
cccccccccccccc
Analiza genomu
- Sekwencjonowanie całogenomowe,
- Sekwencjonowanie de novo,
- Sekwencjonowanie de novo małych genomów (bakterie, drożdże, wirusy) lub plazmidów
- Sekwencjonowanie typu Mate Pair,
- Sekwencjonowanie exomów,
- Resekwencjonowanie celowane,
- Sekwencjonowanie amplikonów,
https://biotechnologia.pl/uslugi/sekwencjonowanie-ngs,1003?c...
Analiza genomów musi zostać przeprowadzona z zastosowaniem różnych technologii obejmujących wysokoprzepustowe sekwencjonowanie genomowego DNA za pomocą krótkich odczytów sparowanych (paired-end), krótkich odczytów typu mate-pair, długich odczytów łączonych (ang. linked-reads), naturalnie długich odczytów analizowanych w czasie rzeczywistym oraz sporządzenie mapy optycznej genomu.
https://ted.europa.eu/udl?uri=TED:NOTICE:571402-2019:TEXT:DA...
4 KudoZ points awarded for this answer.
Comment: "Tu mnie Pan uratował najbardziej!"
Reference comments
2 hrs
Reference:
What is mate pair sequencing for?
You certainly have heard of mate pair sequencing. It’s a smart technique that allows you to obtain paired-end reads with long inserts. That makes it a powerful tool for various sequencing applications including de-novo genome sequencing. Here we will discuss how it works and what are its applications in detail. - https://www.ecseq.com/support/ngs/what-is-mate-pair-sequenci...
Discussion
Segmenty wynikające z cyrkularyzację podczas konstruowanie biblioteki skoki są cięte i fragmenty DNA zawierające znaczniki będą wzbogacone i poddano parami końcowego sekwencjonowania. Te fragmenty DNA były sekwencjonowane z obu końców i generowania pary odczytów. Genomowy odległość pomiędzy odczytuje każdej pary wynosi około znane i stosowane w procesie montażu. Na przykład, DNA klonu wytwarza się przez losową fragmentację około 200 bp, oraz odczyt z każdego końca wynosi około 180bp, zachodzą na siebie. To powinno być odróżniane od sekwencjonowania mate-pair, która jest w zasadzie połączenie Next Generation Sekwencjonowanie z bibliotekami skoków.
- https://pl.qwe.wiki/wiki/Jumping_library#Paired-end_sequenci...